1995年，博格坎普以创俱乐部转会费纪录的750万英镑加盟阿森纳。1996年9月温格加盟后，博格坎普的职业生涯迎来转折点。博格坎普和温格在进攻足球理念、地面传递风格上有着相近的哲学，“教授”深知“冰王子”的技术造诣，因此将他确立为技术化改造的核心人物和进攻端的关键棋子。1997—1998赛季阿森纳夺得双冠王，博格坎普则以22球成为队内最佳射手，场均进球达0.55粒。
在阿森纳，博格坎普则继续享受艺术足球。世纪之交，亨利、皮雷、维尔托德等法国球员让阿森纳实力大增，于2001—2002赛季再次夺得双冠王。2002年3月3日对纽卡斯尔的比赛中，博格坎普更是打入一记“背身人球分过”的不世进球，当时皮雷左路传球至禁区弧顶，博格坎普面对来球脚弓一垫，将球挑向远端，而自己则迅速转身，从近端甩开希腊后卫达比扎斯的防守，在禁区内将球推入球门。
整个人球分过的动作宛若足球场上的华尔兹。这粒进球也是英超历史上最经典的作品之一。2003—2004赛季阿森纳以不败战绩夺得英超冠军，成为英格兰联赛百年来第一支赛季不败夺冠的球队。博格坎普虽然已经35岁高龄，却在亨利狂飙突进、皮雷和永贝里双鬼拍门的进攻体系中如鱼得水。2006年阿森纳历史性地杀入欧冠决赛，无奈败给巴塞罗那，坐在替补席上的博格坎普之后结束了自己20年的职业生涯。2006年7月22日，阿森纳为博格坎普举行了纪念赛，对阵其老东家阿贾克斯。[详细]
